鄠邑区地近古城长安，古为京畿之地，历史悠久，文物古迹星罗棋布。境内现已发现的新石器遗址有25处，在丈南遗址及甘河遗址的粮食窖中，均发现有碳化粳稻，这说明早在六、七千年前的原始公社时，鄠邑区已有人类居住并进行农业生产。
中国历史进入阶级社会后的第一次战争就发生在鄠邑区境内。公元前21世纪，夏代初期禹死后，由其子启继承王位。时鄠邑区为“有扈氏”之国，有扈氏反对继承，要求部落选举，启率大军进行讨伐，战于甘（今甘峪附近），有扈氏败。成语“飞扬跋扈”，就指的是有扈氏《尚书·甘誓》就记载了夏启讨伐有扈氏时在甘地所作的一场临阵演说。有扈氏国为鄠邑区建置最早的方国，商代为崇国，周文王“既伐于崇，作邑于丰”，崇侯虎战败，西周建都于斯。武王灭纣，迁都于镐，丰京不废，每遇大事，皆步行至丰，告于宗庙。周平王东迁，以岐丰之地赐秦襄公，改“扈”为“鄠”邑。秦孝公十二年（前350）迁都咸阳后置鄠县。
1949年5月，鄠县解放后，属陕甘宁边区咸阳分区管辖。中华人民共和国成立后，1950年5月，鄠县属咸阳专区管辖。1953年元月，鄠县直属陕西省人民政府管辖。1958年11月，陕西省人民委员会报请国务院批准，鄠县保留县的建制，划归西安市人民委员会管辖。1961年8月，陕西省人民委员会报请国务院批准，鄠县划归咸阳专区管辖。1964年9月，陕西省人民委员会通知，经国务院批准，将“鄠县”改为“户县”。1969年到1982年，户县属咸阳地区管辖。1983年10月20日将户县划归西安市管辖。2016年12月，经国务院同意户县撤县设区，改为鄠邑区。
